Бюлетень "Ветеринарна біотехнологія"

  • Друк

Ветеринарна біотехнологія. – 2023. – Вип. 42. – С. 91-97. https://doi.org/10.31073/vet_biotech42-10

СИТЮК М.П., д-р вет. наук, ст. наук. сп., e-mail: Ця електронна адреса захищена від спам-ботів. вам потрібно увімкнути JavaScript, щоб побачити її., ТАРАСОВ О.А., к-д вет. наук, ст. наук. сп., e-mail: Ця електронна адреса захищена від спам-ботів. вам потрібно увімкнути JavaScript, щоб побачити її.

Інститут ветеринарної медицини НААН

ГЛАДІЙ М.В., д-р екон. наук, проф., академік НААН, e-mail: Ця електронна адреса захищена від спам-ботів. вам потрібно увімкнути JavaScript, щоб побачити її.

Національна академія аграрних наук України

 

УДОСКОНАЛЕННЯ МЕТОДИКИ ПОЛІМЕРАЗНОЇ ЛАНЦЮГОВОЇ РЕАКЦІЇ В РЕЖИМІ РЕАЛЬНОГО ЧАСУ ДЛЯ ДЕТЕКЦІЇ ДНК ВІРУСУ АФРИКАНСЬКОЇ ЧУМИ СВИНЕЙ

    В статті наведені результати наукових досліджень щодо удосконалення методики постановки полімеразної ланцюгової реакції в режимі реального часу для виявлення ДНК вірусу африканської чуми свиней. Для детекції ДНК вірусу африканської чуми свиней використовували наступні праймери: АЧС F – CTGCTCATGGTATCAATCTTATCGA, АЧС         R – GATACCACAAGATCAGCCGT, АЧС probe – FAM-CCACGGGAGGAATACCAACCCAGTG-TAMRA. Оптимізовано протокол дослідження ПЛР у реальному часі для детекції вірусу АЧС, при цьому найнижча кількість для успішної постановки діагнозу складає 1 × 103 ГЕ/см3 вірусу. Найнижчі стандартне відхилення та коефіцієнт варіації були визначені при температурі 58°C (SD 0,16%, CV 2,02). Отримані дані також свідчать про високу збіжність результатів якісного виявлення ДНК вірусу АЧС.

Ключові слова: африканська чума свиней, полімеразна ланцюгова реакція у режимі реального часу, праймери, валідація.

REFERENCE

  1.  Ministry of agriculture and food production of Ukraine. (2014). Instruktsiya shchodo profilaktiki ta borotbi z afrikanskoyu chumoyu sviney [Regulations on the prevention and control of African swine fever]. Ministry of Agrarian Policy and Food of Ukraine on 05.03.2014 No. 81 [in Ukrainian].
  2. Gallardo, C., Reoyo, A.T., Fernandez-Pinero, J., et al. (2015). African swine fever: a global view of the current challenge. Porcine Health Management, 1(1), 14.
  3. OIE. (2008). African swine fever. OIE Terrestrial Manual, Chapter 2.8.1, 1069-1082. Retrieved from http://web.oie.int/eng/normes/MMANUAL/2008/pdf/2.08.01_ASF.pdf
  4. Nevolko, O.M., Sushko, M.I., Sapachova, M.A., Marushchak, L.V., & Piatenko, S.O. (2014). Diagnostychni skhemy vykorystannya laboratornykh metodiv pry afrikanskii chumi sviney [Diagnostic schemes for the use of laboratory methods in African swine fever]. Veterynarna biotekhnolohiia – Veterinary biotechnology, 25, 67-70 [in Ukrainian].
  5. Tignon, M., Gallardo, C., Iscaro, C., et al. (2011). Development and inter-laboratory validation study of an improved new real-time PCR assay with internal control for detection and laboratory diagnosis of African swine fever virus. Journal of Virological Methods, 178(1-2), 161-170.
  6. King, D.P., Reid, S.M., Hutchings, G.H., et al. (2003). Development of a TaqMan PCR assay with internal amplification control for the detection of African swine fever virus. Journal of Virological Methods, 107(1), 53-61.
  7. Wang, K., Wang, X., Liu, Y., et al. (2019). Development of a recombinase polymerase amplification assay for African swine fever virus detection. Journal of Virological Methods, Vol. 276, 113761. https://doi.org/10.1016/j.jviromet.2019.113761.
  8. Sanchez-Vizcaino, J., Mur, Y., Martínez-Lopez, J.C. (2012). African swine fever virus: a review. Viruses, 4, 1536-1558. https://doi.org/10.3390/v4091536.
  9. Mandyhra, S.S., Myzykina, L.M., Ishchenko, L.M., Kovalenko, H.A., Halka, I.V., Sytyuk, M.P., Nychyk, S.A., & Spiridonov, V.G. (2017). Rozrobka test-sistemy dlia diferentsiinoi diagnostyky afrykanskoi ta klasychnoi chumy svynei metodom ZT-PLR u rezhymi realnoho chasu [Development of a test kit for differential diagnosis of African and classical swine fever by real-time PCR]. Veterynarna biotekhnolohiia – Veterinary biotechnology, 31, 101-109. https://doi.org/10.31073/vet_biotech31-128 [in Ukrainian].
  10. Mandygra, S.S., Muzykina, L.M., Ishchenko, L.M., Halka, I.V., Spiridonov, V.G., Sityuk, M.P., & Nychyk, S.A. (2017). Pidbir praimeriv ta optymizatsiia metodu PLR dlia detektsii DNK virusu AChS [Selection of primers and optimization of PCR method for detection of ASFV DNA]. Veterynarna medytsyna – Veterinary Medicine, 103, 304-306 [in Ukrainian].
  11. Sun, Q., Zhao, Y., Xu, Z. et al. (2019). Emergence and spread of African swine fever virus variant, China 2018. Emerging Infectious Diseases, 25, 1431-1433. https://doi.org/10.3201/eid2507.190268.
  12. Vu, T.H.T., Pham, A., Nguyen, T., et al. (2020). Clinical and virological features of African swine fever in domestic pigs in Vietnam 2019. Transboundary and Emerging Diseases, 67, 1393-1399.

Повний текст статті у форматі PDF